一、使用前檢查：
1.接通生物安全柜的電源。
2.打開風機開關，運轉風機，檢查高效過濾器出風面是否有風送出。
3.檢查照明及紫外設備能否正常運行。
4.工作前必須對生物安全柜周圍的環境及空氣進行潔凈處理，認真進行清潔工作，并用臭氧消毒法進行殺菌處理。
5.操作前應將實驗操作所需的物品全部移入生物安全柜，避免人員在操作過程中手臂頻繁穿過氣幕而破壞氣流。
二、使用：
1.使用生物安全柜時，先用70%的酒精或消毒劑擦拭生物安全柜臺面。并打開紫外線殺菌燈。
2.60分鐘后，關閉紫外線燈，打開送風機。
3.打開風機5～10分鐘，等柜內空氣凈化好并氣流穩定后再進行實驗操作。將雙臂緩緩伸入安全柜內，靜止至少1分鐘，使柜內氣流穩定后再進行操作。
4.生物安全柜內不得放與本次實驗無關的物品。柜內物品擺放應做到清潔區、半污染區與污染區基本分開，操作過程中物品取用方便，且三區之間無交叉。物品應盡量靠后放置，但不得擋住氣道口，以免干擾氣流正常流動。
5.工作時盡量減少背后人員走動以及快速開關房門，以防止安全柜內氣流不穩定。
6.工作時不要將移門移過安全線的高度（200mm處），應保證操作者臉部在工作窗口之上。若移門開口抬高至200mm以上，則有氣流不能平衡的危險。（當移門門開口抬高到200mm以上時，則蜂鳴叫報警）。在柜內操作時動作應輕柔、舒緩，防止影響柜內氣流。
7.操作結束后，清理工作臺面，收集各類廢棄物，關閉風機及照明開關，用清潔劑及消毒劑擦拭消毒。
8.工作完全后，關閉玻璃窗，保持風機繼續運轉10～15分鐘，同時打開紫外燈，照射30分鐘，關閉紫外燈，切斷電源。
三、保養：
1.生物安全柜工作環境應在：溫度18—26℃；濕度：45—65%的潔凈區工作，電源應設有專門開關。
2.日常維護保養需要消毒和清潔工作室，對操作臺面進行清潔和消毒時要用柔性清潔劑清潔箱體和外表玻璃。當生物安全柜使用一段時間后，應作性能檢測（一般每兩月一次)，用風速儀測量工作區風速(送風風速0.3m/s,工作窗口進風速0.55m/s),如發現不符合技術參數的要求,則可調大風機供電電壓。
3.當風機電壓調到最大時,工作區風速仍達不到技術特性中規定的風速時,則必需更換高效空氣過濾器,更換送風高效空氣過濾器時也必需更換排風高效空氣過濾器,更換完畢后,應用塵埃粒子計數器檢查四周密封是否良好,若有泄漏需用密封膠封堵,潔凈度按百級標準測試合格.換下來的高效空氣過濾器需經高溫滅菌后,用朔料袋密封,送至公司廢物處治箱,統一處理。
4.定期進行無菌狀況測定，方法為取普通肉湯培養基三個分置臺上，左中右開蓋30分鐘，在適宜溫度下培養48小時，應無菌生長。
四、清潔：
1.按《清潔劑配制標準操作規程》配制清潔劑（1%洗潔精），按《消毒劑配制標準操作規程》配制消毒劑（75%酒精，0.2%新潔爾滅）。
2.準備好清潔與消毒用的工具（抹布、塑料桶等）。
3.每次測定結束后，將工作臺上所有物品撤離，然后開展清洗、消毒工作。
4.先用蘸清潔劑的抹布自上而下由里至外擦拭生物安全柜內壁臺面和外壁，然后用蘸純化水的抹布擦拭去清潔劑，最后用蘸消毒劑的抹布擦拭內壁臺面和外壁，15分鐘后，用蘸純化水的抹布擦拭去消毒劑。
5.消毒完畢，開啟紫外線燈30分鐘，進行空間消毒。
6.消毒劑必須每月交換使用。
7.每次使用完畢，立即清潔儀器，并填寫儀器使用記錄。
8.要經常用抹布沾上75%酒精將紫外線殺菌燈表面擦干凈,保持表面清潔,否則會影響殺菌能力.
9.清潔效果評價：設備內外表面應該光亮整潔，沒有污跡。
